Nástroj System Center Configuration Manager (SCCM) umožňuje hromadně nasazovat a konfigurovat software, operační systémy a celkově automatizovat správu prostředí na úrovni, jakou známe u velkých organizací, i malým podnikům. Tento nástroj se však nehodí pro správu všech typů koncových zařízení, především mobilních telefonů a tabletů. Microsoft má ale i pro tuto oblast řešení, které se jmenuje Microsoft Intune. Jedná se o online službu, určenou především ke správě mobilních a přenosných zařízení.
Microsoft Intune dokáže pokrýt Mobile Device Management, Mobile Application Management a umí zabezpečit mobilní koncová zařízení. Pomocí spojení nástroje SCCM a Microsoft Intune dokážete pokrýt kompletní správu koncových zařízení včetně linuxových platforem, MacOSx a všech hlavních mobilních operačních systémů.
Od prosince 2019 společnost Microsoft umožnila všem uživatelům, kteří mají licence System Center Configuration Manager Client Management License na uživatele s aktivním pokrytím Software Assurance (případně Core/Enterprise CAL Suite s SA), bezplatně používat službu Microsoft Intune v režimu co-management, což znamená současné využití SCCM a Intune. Díky tomuto propojení lze získat to nejlepší z obou nástrojů a dramaticky zlepšit a automatizovat správu koncových zařízení, operačních systémů a aplikací.